Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Sec22bO08547 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms