Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Gm10378F6XQQ1 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gm10378F6XQQ1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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