Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm3298E9PW80 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms