Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Usf3B2RUQ2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Usf3B2RUQ2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms