Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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