Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp42B2RQC2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp42B2RQC2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms