Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C8

Gm5089, EG328479 protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5089A1L3C8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5089A1L3C8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms