Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn13Q9Z0S4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Cldn13Q9Z0S4 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn13Q9Z0S4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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