Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Kcnip3Q9QXT8 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms