Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Rabgef1Q9JM13 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rabgef1Q9JM13 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms