Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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