Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Scamp5Q9JKD3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Scamp5Q9JKD3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms