Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clstn1Q9EPL2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Clstn1Q9EPL2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms