Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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