Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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