Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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TrmuQ9DAT5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TrmuQ9DAT5 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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