Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Phf6Q9D4J7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Phf6Q9D4J7 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms