Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pus10Q9D3U0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Pus10Q9D3U0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pus10Q9D3U0 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms