Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms