Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms