Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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