Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Sgo1Q9CXH7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sgo1Q9CXH7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sgo1Q9CXH7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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Sgo1Q9CXH7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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