Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWF6

Bbs2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs2Q9CWF6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Bbs2Q9CWF6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Bbs2Q9CWF6 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms