Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rhobtb3Q9CTN4 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms