Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms