Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Kcne3-203ENSMUST00000178946 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4dQ99N05 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms