Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp1b4Q99ME6 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms