Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pacsin3Q99JB8 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms