Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Krt79Q8VED5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Krt79Q8VED5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms