Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cdk8Q8R3L8 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cdk8Q8R3L8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms