Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrit1Q8K099 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrit1Q8K099 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrit1Q8K099 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Lrit1Q8K099 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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