Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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LgsnQ8CIX8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
LgsnQ8CIX8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms