Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Klf17Q8CFA7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf17Q8CFA7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms