Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Nup88Q8CEC0 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Nup88Q8CEC0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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