Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc38Q8CDN8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms