Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cnot2Q8C5L3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 691.5 ms