Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp54Q8BL06 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms