Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atg4dQ8BGV9 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atg4dQ8BGV9 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atg4dQ8BGV9 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Atg4dQ8BGV9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4dQ8BGV9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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Atg4dQ8BGV9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4dQ8BGV9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms