Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms