Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Krt40Q6IFX3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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