Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hes3Q61657 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms