Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnot7Q60809 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnot7Q60809 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnot7Q60809 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot7Q60809 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms