Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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Gm6899Q3USS0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm6899Q3USS0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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