Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gtpbp2Q3UJK4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gtpbp2Q3UJK4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms