Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q3U6N9 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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