Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rnf149Q3U2C5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Rnf149Q3U2C5 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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