Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Trappc9Q3U0M1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Trappc9Q3U0M1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms