Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tcf7l2-208ENSMUST00000111654 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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