Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
KncnQ307W7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
KncnQ307W7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms