Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rundc1Q0VDN7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms